Im Anschluss an seine Ausbildung zum Finanzwirt studierte Markus Assenmacher Deutsches und Europäisches Wirtschaftsrecht mit den Schwerpunkten Wirtschafsprüfung sowie Konzern- und Umwandlungsrecht an den Universitäten in Siegen und Athen. Danach arbeitete er einige Jahre bei einer „Big Four Wirtschaftsprüfungsgesellschaft“ in Hamburg und war anschließend für eine mittelständische Wirtschaftsprüfungs- und Steuerberatungsgesellschaft in Flensburg tätig.
2010 folgte die Bestellung zum Steuerberater und 2013 zum Wirtschaftsprüfer. Der Schwerpunkt seiner Tätigkeit liegt in der Prüfung und Erstellung von Jahres- und Konzernabschlüssen nach HGB und IFRS, der steuerlichen und betriebswirtschaftlichen Beratung mittel-ständischer und eigentümergeführter sowie öffentlicher Unternehmen. Zu seinen weiteren Betätigungsfeldern gehören Sonderprüfungen sowie Unternehmensbewertungen.